In alternative embodiments, the invention provides compositions and methods for treating various disorders and conditions in mammals, including chronic disorders in which there is a presence of an abnormal microbiota or an abnormal distribution of microflora in the gastrointestinal tract. In alternative embodiments, the invention provides liquid preparations or formulations derived from a human fecal material (e.g., a stool) processed, e.g., filtered and/or centrifuged, such that all bacteria, fungal spores and viruses are removed, but retaining the native biologically active molecules from the fecal material and bacteriophages. In alternative embodiments, the invention provides a &ldquo；rough-&rdquo；, &ldquo；incomplete-&rdquo； or medium-filtered microbiota which still comprises native physiological components or nutritive agents for the bacteria, e.g., retains native biologically and nutritionally active components. In alternative embodiments, the invention provides a highly filtered or substantially purified microbiota in combination with, or having added back, a liquid preparation or formulation of the invention. In alternative embodiments, the invention provides compositions or formulations where the bacteria, or microbiota, component has been cultured, or cultured under anaerobic conditions, or harvested, stored and/or cultured under anaerobic conditions. In alternative embodiments, the invention provides various additives, compositions and donor restrictions for treating these disorders and conditions.대체적인 실시예들에 있어서, 본 발명은 위장 트랙트 내에 비정상 마이크로바이오타 또는 비정상 마이크로플로라 분포가 존재하는 만성 장애를 포함하는 포유류의 다양한 장애 및 증상들을 치료하기 위한 조성물 및 방법들을 제공한다. 대체적인 실시예들에 있어서, 본 발명은 처리된, 예를 들면 여과 및/또는 원심분리되어 모든 박테리아, 진균 포자 및 바이러스들이 제거되나, 천연 생물학적 활성 분자들을 분변 물질 및 박테리오파지로부터 유지하는 인간 분변 물질(예를 들면, 대변)로부터 유도된 액상 제제 또는 제형들을 제공한다. 대체적인 실시예들에 있어서, 본 발명은 여전히 천연 생리학적 성분들 또는 박테리아의 영양 제제들을 포함하는, 예를 들면 천연 생물학적 및 영양학적 활성 성분들을 유지하는 "러프-","불완전-" 또는 미디엄- 여과된 마이크로바이오타를 제공한다. 대체적인 실시예들에 있어서, 본 발명은 본 발명의 액상 제제 또는 제형과 조
