本发明公开了一种凡纳滨对虾纤维蛋白原LvFREP及其编码基因和应用。所述的凡纳滨对虾纤维蛋白原基因LvfreP的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示,其编码蛋白LvFREP的氨基酸序列如SEQ ID NO.3所示。本发明首次从凡纳滨对虾中克隆出纤维蛋白原基因LvfreP,通过实验证明该基因表达产物LvFREP在体外对多种细菌具有强烈凝集作用,在虾体内可快速帮助虾体清除细菌。因此,本发明所提供的凡纳滨对虾纤维蛋白原基因LvfreP和纤维蛋白原LvFREP为筛选具有优良性状的凡纳滨对虾家系提供了遗传标记,也为凡纳滨对虾遗传改良提供了新的靶位点。