In particular, in alternative embodiments, the invention provides pharmaceutical compounds and formulations comprising a family of epoxyketone compounds, which include racemic mixtures or racemates, isomers, stereoisomers, diastereoisomers, derivatives and analogs, and methods for making and using them. In alternative embodiments, pharmaceutical compositions and formulations of the invention are administered to an individual in need thereof in an amount sufficient to treat, prevent, reverse and/or ameliorate an infection, disease or condition that can be ameliorated, treated, prevented or reversed by partially or completely inhibiting a chymotrypsin-like protease or a proteasome activity, including e.g., a retroviral infection such as human immunodeficiency virus-1 (HIV-1) infection, an immune disorder, a neurodegenerative disease or condition, or a cancer such as a myeloma or multiple myeloma, an adenocarcinoma such as a lung adenocarcinoma, a pancreatic cancer, a B-cell related cancer, and lymphomas such as non-Hodgkins lymphoma.Linvention concerne, en particulier dans des modes de réalisation alternatifs, des composés et des formulations pharmaceutiques qui comportent une famille de composés époxycétones, qui comprennent des mélanges racémiques ou des racémates, des isomères, des stéréo-isomères, des diastéréo-isomères, des dérivés et des analogues, et des procédés de fabrication et dutilisation de ceux-ci. Dans des modes de réalisation alternatifs, les compositions et les formulations pharmaceutiques de linvention sont administrées à un individu qui en a besoin en une quantité suffisante pour traiter, prévenir, inverser et/ou améliorer une infection, une maladie ou un état qui peut être amélioré, traité, prévenu ou inversé par linhibition partielle ou complète dune protéase de type chymotrypsine ou dune activité du protéasome, comprenant par exemple une infection rétrovirale, telle quune infection par le virus 1 de limmunodéficience humaine (VIH-1), un trouble i
