A method for purification of complement Factor H from a complement Factor H containing source such as blood or blood plasma, in particular a caprylate precipitate of a Factor H containing source, which is e.g. obtained by addition of caprylate ions to fractions of blood or plasma, comprising the steps of: a)providing a Factor H containing source, in particular reconstitution of caprylate precipitate to provide a complement Factor H containing solution b)performing a cation exchange chromatography in particular as first chromatographic step c)performing an anion exchange chromatography d)performing a hydroxyl apatite chromatography e)followed by ultra/diafiltration to obtain a complement Factor H concentrate.La présente invention concerne une méthode de purification du facteur H du complément à partir dune source contenant du facteur H du complément comme le sang ou le plasma sanguin, en particulier un précipité de caprylate dune source contenant du facteur H, qui sobtient par exemple par ajout dions caprylate à des fractions de sang ou de plasma, comprenant les étapes consistant à : a) fournir une source contenant du facteur H, en particulier reconstituer un précipité de caprylate pour fournir une solution contenant du facteur H du complément b) effectuer une chromatographie à échange de cations, en particulier comme première étape chromatographique c) effectuer une chromatographie à échange danions d) effectuer une chromatographie sur hydroxyapatite e) puis effectuer une ultra/diafiltration pour obtenir un concentré de facteur H du complément.