本发明涉及一种用于鉴定野生人参与栽培人参的SNP分子标记及其检测方法,其包括如下步骤:(1)提取待检测人参样品的DNA,作为扩增模板;(2)使用上下游引物进行PCR扩增反应,扩增含有SEQ ID No.1所示序列的片段;(3)对扩增产物进行测序,通过分析SEQ ID No.1所示的序列,确定自SEQ ID No.1所示序列的5’端起第236位的碱基。如果自SEQ ID No.1所示序列的5’端起第236位点处为C,则样品鉴定为野生人参,如果自SEQ ID No.1所示序列的5’端起第236位点处为缺失,则样品鉴定为栽培人参。本发明能够实现野生人参和栽培人参的药材的准确鉴定。