Disclosed is a pulp canal filling material having an isoprene structure. According to an embodiment of the present invention, the pulp canal filling material having the isoprene structure includes a molecular structure which is perfectly identical to isoprene, and further includes gutta taban at an exterior. In addition, an interior of the material is made of a synthetic resin having elasticity exceeding a predetermined level, and also includes nanosilver and an aromatic component.아이소프렌 구조의 치근관 충전제가 개시된다. 본 발명의 일 실시예에 따른 아이소프렌 구조의 치근관 충전제는 분자구조가 완벽히 일치하는 아이소프렌 분자 구조를 가지고, 외부는 구타페르카로 구성되고, 내부는 미리 설정된 정도 이상의 탄력성을 갖는 합성수지로 구성되며, 은나노와 방향 성분이 포함된다.