Selective reaction monitoring (SRM) / multiple reaction monitoring (MRM) mass spectrometry by measuring modified forms of certain peptides of the present disclosure derived from ENT1, ERCC1, FOLR1, RRM1, TUBB3, TOP01, and / or TOP02A proteins Quantitative analysis of protein that is the target of chemotherapy. These peptides can be quantified if their modified form contains tyrosine, threonine, serine and / or other amino acid residues phosphorylated within their amino acid sequence. Biological samples fixed in formalin are used for analysis.ENT1、ERCC1、FOLR1、RRM1、TUBB3、TOP01、及び/またはTOP02Aタンパク質由来の本開示の特定のペプチドの修飾形態を測定することにより、選択反応モニタリング(SRM)/多重反応モニタリング(MRM)質量分析法による化学療法の標的であるタンパク質の定量分析。これらのペプチドは、それらの修飾形態が、それらのアミノ酸配列内にリン酸化された、チロシン、トレオニン、セリン及び/または他のアミノ酸残基を含む場合に、定量することができる。ホルマリン中で固定されている生体試料を分析に使用する。