本发明公开了一种含益生菌的切达干酪及其制备方法。该制备方法包括如下步骤:(1)将除杂后的原料乳与果蔬汁均匀混合,之后于60℃-65℃下杀菌25min-35min,冷却至30℃-35℃,之后原料乳每1000重量份接入含有植物乳杆菌ST-III(Lactobacillus plantarum ST-III)工作发酵剂0.01-0.02重量份,以及发酵剂,混合均匀后发酵,之后再加入凝乳酶凝乳;(2)将步骤(1)所得凝乳切割成凝块,放置,以1℃/5min-8min速率升温至36℃-38℃,在该温度保持至乳清酸度0.20%-0.22%,排乳清,堆积,切块加盐,之后装模,真空包装,成熟即可。该干酪属于天然干酪,可同时发挥干酪和益生菌的综合功能,益生菌在干酪中能很好地增殖,在保质期内保持高的活菌数,并且干酪正常的风味和质地能够得到良好的保持。