The present invention relates to a nanoliposome carrier composition containing a hybrid of Cas9 protein and guide RNA. More specifically, the present invention relates to a nanoliposome carrier composition in which a hybrid of Cas9 protein and a guide RNA specific to target DNA is encapsulated. The nanoliposome carrier composition excellently inhibits expression of the target DNA, and thus pharmaceutical compositions containing the nanoliposome carrier composition can be easily used as the pharmaceutical compositions for ameliorating or treating diseases such as diabetes.본 발명은 Cas9 단백질 및 가이드 RNA의 혼성체를 함유하는 나노 리포좀 전달체 조성물에 관한 것으로서, 보다 자세하게는 본 발명은 Cas9 단백질 및 표적 DNA에 특이적인 가이드 RNA의 혼성체가 봉입된 나노 리포좀 전달체 조성물에 관한 것이다. 상기 나노 리포좀 전달체 조성물은 표적 DNA의 발현을 억제하는 효과가 우수하여, 상기 나노 리포좀 전달체 조성물이 포함된 약학 조성물은 당뇨병과 같은 질병을 개선 또는 치료할 수 있는 약학조성물로서 용이하게 이용될 수 있다.