KESSLER, Kallie C.,PATTERSON, Eric L.,FLEMING, Margaret B.,GAINES, Todd
申请号:
USUS2017/031536
公开号:
WO2017/196720A1
申请日:
2017.05.08
申请国别(地区):
US
年份:
2017
代理人:
摘要:
Methods are provided for high throughput genotyping of plants, utilizing at least three primers, one primer recognizing a polymorphic sequence of a first species of a plant genus, a second primer recognizing a second polymorphic sequence of a second species, and a third primer that recognizes sequences of both the first and second species and producing a measurable signal when amplifying a plant DNA-containing sample. Additional primers recognizing additional species may also be employed. The method may be repeated for multiple sequences each diagnosing a species or hybrid, and results analyzed using data from multiple assays to improve the statistical robustness of genotyping results. Controls are provided in which the primer target sequences are introduced into and extracted from bacteria and the measurable signal used as a control. The methods are particularly useful for genotyping a population of plants, especially where weed species and/or hybrids are present.L'invention concerne des procédés à haut rendement pour le génotypage de plantes, les procédés utilisant au moins trois amorces : une amorce qui reconnaît une séquence polymorphe d'une première espèce d'un genre de plante, une deuxième amorce qui reconnaît une deuxième séquence polymorphe d'une deuxième espèce, et une troisième amorce qui reconnaît à la fois les séquences des première et seconde espèces et qui produit un signal mesurable lors de l'amplification d'un échantillon contenant de l'ADN de plante. Des amorces supplémentaires qui reconnaissent des espèces supplémentaires peuvent également être utilisées. Le procédé peut être répété pour de multiples séquences servant chacune à diagnostiquer une espèce ou un hybride, et les résultats peuvent être analysés à l'aide de données provenant de plusieurs essais pour améliorer la robustesse statistique des résultats du génotypage. L'invention concerne également des témoins, dans lesquels les séquences cibles d'amorce sont introduites dans des bactéries et