Disclosed are systems and methods for diagnosing a disease status or progression of a disease comprising detection and correlation of methylation and expression level changes of cancer markers including PD-L1 in a biofluid sample from the patient. The systems and methods are similarly applicable to the detection and correlation of methylation and expression level changes in solid tissues. The present method utilized a barcoding method for analysis. The systems and methods can be used for predicting immunotherapy resistant cancer and monitoring therapy response.L'invention concerne des systèmes et des procédés permettant de diagnostiquer un état pathologique ou la progression d'une maladie comprenant la détection et la corrélation de changements de niveau de méthylation et d'expression de marqueurs du cancer, comprenant PD-L1, dans un échantillon de fluide biologique du patient. Les systèmes et les procédés sont applicables de manière similaire à la détection et à la corrélation de changements de niveau de méthylation et d'expression dans des tissus solides. Le présent procédé utilise un procédé de codage à barres pour l'analyse. Les systèmes et les procédés peuvent être utilisés pour prédire un cancer résistant à l'immunothérapie et pour surveiller une réponse thérapeutique.