本发明涉及一种水稻缺铁诱导启动子及其应用，具有：i)SEQ ID NO.1所示的核苷酸序列；或ii)SEQID NO.1所示核苷酸序列经取代、缺失和/或添加一个或几个核苷酸且同等功能的由i)衍生的核苷酸序列。本发明还提供含有上述启动子的载体、转基因细胞系以及工程菌。还提供上述启动子在启动目的基因表达中的应用。还提供上述启动子在转基因植物中的应用；方法为将重组载体导入所述目的植物，从而在所述目的植物中用所述DNA片段启动GUS基因的表达。本发明有益的效果是：本发明启动子的发现及其功能的阐释，将对水稻耐受缺铁逆境生理机制的研究，有效地开展水稻抗缺铁环境胁迫及富铁育种均具有重要理论和实践意义。
