PROBLEM TO BE SOLVED: To provide a biological signal analyzer capable of extracting a fundamental frequency component of a pulse wave signal without obtaining a pulse rate, and a control method thereof. SOLUTION: A first pulse wave signal based on a change in the amount of reflected light or transmitted light of light having a first wavelength irradiated to a living tissue is acquired. The signal processing unit 130 extracts a fundamental frequency component from the first pulse wave signal and outputs it by using an adaptive bandpass filter 133 that uses an adaptive algorithm for estimating the fundamental frequency. [Selection diagram] Fig. 2【課題】脈拍数を求めることなく脈波信号の基本周波数成分を抽出可能な生体信号解析装置およびその制御方法を提供すること。【解決手段】生体組織に照射された第1の波長の光の反射光もしくは透過光の光量変化に基づく第1の脈波信号を取得する。信号処理部130は、基本周波数を推定する適応アルゴリズムを用いる適応バンドパスフィルタ133を用いて、第1の脈波信号から基本周波数の成分を抽出して出力する。【選択図】図2