Provided is a medical image processing apparatus capable of determining the state of an acquired brain image and adjusting it to a brain image suitable for tissue separation processing. The medical image processing apparatus selects a slice image to be processed as a target slice from a brain image composed of a plurality of slice images, and from the selected target slice, a measurement process of the effective maximum value of the brain parenchyma, the brain image The entire effective maximum value measurement process and the cranial orbit peak average value measurement process are executed. Based on the measured brain parenchyma effective maximum value, the entire brain image effective maximum value, the cranial orbit peak average value, It is determined whether the high signal value suppression process is necessary or not, and when it is determined that the high signal value suppression process is necessary, the high signal value suppression process is executed on the brain image.取得した脳画像の状態を判定し、組織分離処理に適した脳画像に調整することが可能な医用画像処理装置を提供する。医用画像処理装置は、複数のスライス画像で構成される脳画像から、処理対象とするスライス画像を対象スライスとして選択し、選択された対象スライスから、脳実質の有効最大値の計測処理、脳画像全体の有効最大値の計測処理、頭蓋周回のピーク平均値の計測処理を実行し、計測された脳実質の有効最大値、脳画像全体の有効最大値、頭蓋周回のピーク平均値に基づいて、高信号値抑制処理が必要か不要かを判定し、高信号値抑制処理が必要と判定された場合に、脳画像に対して高信号値抑制処理を実行する。