A 3D medical information input method and system is presented. The 3D medical information input method proposed in the present invention shows and selects a cut surface of a position to be recorded from the input 3D human body model, and selects a location to which a lesion should be input on the cut surface of the selected 3D human body model. And inputting a lesion model containing medical information at a selected location and automatically generating visual information and documents for recording the disease state by combining the input lesion model and a 3D human body model.3D 의료정보 입력 방법 및 시스템이 제시된다. 본 발명에서 제안하는 3D 의료정보 입력 방법은 입력된 3차원 인체 모델로부터 기록하고자 하는 위치의 절단면을 보여주고 선택하는 단계, 선택된 3차원 인체 모델의 절단면에서 병변이 입력되어야 할 위치를 선정하는 단계, 선정된 위치에 의료 정보를 포함하고 있는 병변 모델을 입력하는 단계 및 입력된 병변 모델과 3차원 인체 모델을 조합하여 질병 상태를 기록하기 위한 시각적인 정보 및 문서를 자동 생성하는 단계를 포함한다.