The present disclosure pertains to a ventilation therapy system configured to control a pressure or flow generator to apply an intra-pulmonary percussive ventilation therapy regime to a pressurized flow of breathable gas during baseline ventilation therapy. The ventilation therapy system is configured to automatically control the pressurized flow of breathable gas. The system may automatically control an extent of hyperinflation during IPPV in a subject. The system is configured such that therapy set points, alarm settings, and/or other factors are automatically adjusted during the application of IPPV relative to the set points and alarm settings during baseline ventilation therapy. In some embodiments, the system comprises one or more of a pressure or flow generator, a subject interface,one or more sensors, one or more processors, a user interface, electronic storage, and/or other components.La présente invention concerne un système de thérapie de ventilation configuré pour commander à un générateur de pression ou de flux dappliquer un régime de thérapie de ventilation percussive intrapulmonaire à un flux pressurisé de gaz respirable durant une thérapie de ventilation initiale. Le système de thérapie de ventilation est configuré pour automatiquement commander le flux de gaz respirable pressurisé. Le système peut automatiquement commander un degré dhyperinflation durant lIPPV chez un sujet. Le système est configuré de telle manière que les points de consigne de la thérapie, les paramètres dalarme, et/ou autres facteurs sont automatiquement ajustés durant lapplication de lIPPV relativement aux points de consigne et paramètres dalarme définis durant la thérapie de ventilation initiale. Dans certains modes de réalisation, le système comprend au moins lun dun générateur de pression ou de flux, dune interface sujet, dun ou plusieurs capteurs, dun ou plusieurs processeurs, dune interface utilisateur, dun stockage électronique, et/ou dautres composants.