本发明公开了鉴定或辅助鉴定香蕉枯萎病菌的成套引物及应用。本发明所提供的鉴定或辅助鉴定香蕉枯萎病菌的成套引物,为成套引物1、成套引物2或成套引物3;所述成套引物1由名称为A的PCR引物对、名称为B的PCR引物对和名称为C的PCR引物对组成;所述A由序列表中SEQ ID No.1和SEQ ID No.2所示的两条单链DNA组成;所述B由序列表中SEQ ID No.3和SEQ ID No.4所示的两条单链DNA组成;所述C由序列表中SEQ ID No.5和SEQ ID No.6所示的两条单链DNA组成。所述成套引物2由所述A和所述C组成。所述成套引物3由所述B和所述C组成。