本发明公开了PINNATE PENTAFOLIATA2基因(其核苷酸序列如SEQ ID No.1所示)在调控豆科植物小叶数量中的应用。本发明首次分离得到了蒺藜苜蓿PINNATE PENTAFOLIATA2基因的敲除突变体株系,发现植株的小叶片数目由三个变为五个,少数为四个。获得的植株中多达97%的叶片的小叶片数量提高,这一数据远高于目前现有的多叶苜蓿品种。这证明,该基因参与了调控豆科植物的小叶数量,敲除该基因,可以得到小叶数量高于野生型植株的转基因豆科植物,预示本发明实施后将会创造新型豆科牧草植物,可用于后续的牧草品质,对我国草业生产具有重大意义。