一种批量计算基因组直系同源基因进化速率的方法
- 专利权人:
- 江苏省农业科学院
- 发明人:
- 郭月,刘静,杜建厂
- 申请号：
- CN201510965003.3
- 公开号：
- CN105426700B
- 申请日:
- 2015.12.18
- 申请国别(地区):
- 中国
- 年份:
- 2018
- 代理人:
- 徐蓓
- 摘要：
- 本发明公开了一种批量计算基因组直系同源基因进化速率的方法。本发明所提供的计算基因组直系同源基因进化速率的方法综合运用了基于Blast成对比对结果后进行聚类搜索直系同源基因的InParanoid程序，基于多序列比对分析的MUSCLE程序，基于编码蛋白DNA序列之间的比较来评估同义和非同义替代比率的PAML软件包yn00程序，以及结合Perl脚本语言编程等方法。实验证明，本发明所提供的批量计算基因组直系同源基因进化速率的方法比较系统，检测基因组计算基因组直系同源基因进化速率各参数值的重复效果好，速度快，易实现批量化、自动化和流程化。
- 来源网站：
- 中国工程科技知识中心
