To provide a medical device, a method of controlling a medical device, and a program capable of reporting whether a respiration waveform is significantly related to a treatment timing.SOLUTION: A medical device 100 includes an acquisition unit 130, an association unit, and a display control unit 124. The acquisition unit acquires information indicating a respiration waveform of a subject, and acquires a fluoroscopic image of the subject taken in time series. The association unit associates a tracking value that varies due to a respiration phase of the subject on the basis of the time-series fluoroscopic image. The display control unit displays the respiration waveform and the waveform of the tracking value on a display unit 120 in a comparable manner.SELECTED DRAWING: Figure 1【課題】呼吸波形が治療タイミングに有意に関連しているかを知らせることができる医用装置、医用装置の制御方法、およびプログラムを提供する。【解決手段】医用装置100は、取得部130と、対応付部と、表示制御部124と、を持つ。取得部は、被検体の呼吸波形を示す情報を取得すると共に、時系列に前記被検体を撮影した透視画像を取得する。対応付部は、前記時系列の透視画像に基づいて、被検体の呼吸位相に起因して変動する追跡値を対応付ける。表示制御部は、呼吸波形と追跡値の波形とを比較可能な態様で表示部120に表示させる。【選択図】図1