The present invention relates to a method for genotyping highly polymorphic nucleic acids. In particular, the present disclosure relates to a method for genotyping a highly polymorphic gene allele such as HLA allele using high throughput sequencing techniques. In particular, the present invention relates to a capture probe method suitable for identifying alleles in highly polymorphic genes by targeting capture probes to non-coding sequences.Selection drawing None本発明は、高度多型性核酸をジェノタイピングする方法に関する。特に、本開示は、ハイスループットシーケンシング技術を用いて、HLAアリルなどの高度多型性遺伝子アリルをジェノタイピングするための方法に関する。とりわけ、本発明は、非コード配列へとキャプチャープローブを標的化することにより、高度多型性遺伝子におけるアリルを同定するのに適したキャプチャープローブ方法に関する。【選択図】なし