The present invention provides a process for preparing low sodium miso containing polyphenols comprising the steps of: (a) preparing meju; (b) 100-100 parts by weight of Meju, 70-120 parts by weight of salt based on 100 parts by weight of Meju, 10-30 parts by weight of powdery mulberry wormwood or 1-10 parts by weight of mulberry wormwood extract and 5-20 parts by weight of loess germanium ball To prepare a mixture; And (c) fermenting the mixture of step (b). The doenjang composition prepared by the method of the present invention has a low sodium content and can minimize the occurrence of adult diseases such as hypertension and exhibits a high antioxidative effect due to its high polyphenol content.본 발명은 다음의 단계를 포함하는 폴리페놀 함유 저 나트륨 된장 제조방법을 제공한다: (a) 메주를 제조하는 단계; (b) 상기 메주 100 중량부, 상기 메주 100 중량부를 기준으로 소금 70-120 중량부 , 개똥쑥 전초 10-30 중량부 또는 개똥쑥 추출물 1-10 중량부, 황토 게르마늄 볼 5-20 중량부를 첨가하여 혼합물을 제조하는 단계; 및 (c) 상기 단계 (b)의 혼합물을 발효하는 단계. 본 발명의 방법으로 제조한 된장 조성물은 나트륨 함량이 낮아 고혈압 등의 성인병 발생을 최소화 할 수 있는 것은 물론, 폴리페놀 함량이 높아 높은 항산화 효과를 나타낸다.