The invention relates to of analyzing vector supernatants useful for transducing T cells destined for administration to a human subject. The invention also related to methods of analyzing transduced T cells destined for administration to a human subject. The invention provides a method of analyzing a genetically modified T cell to detect a contaminant, wherein the genetically modified T cell comprises a nucleic acid encoding a chimeric antigen receptor (CAR), wherein the CAR comprises an antigen binding domain, a transmembrane' domain, a costimulatory signaling region, and a signaling domain. In one embodiment, the contaminant is at least one selected from the group consisting of endotoxin, mycoplasma, replication competent lentivirus (RCL), p24, VSV-G nucleic acid, HN gag, residual anti-CD3/anti-CD28 coated beads, mouse antibodies, pooled human serum, bovine serum albumin, bovine serum, culture media components, vector packaging cell or plasmid components, a bacterium and a fungus.La presente invención se refiere a un método in vitro para analizar una célula T genéticamente modificada para detectar al menos un contaminante, en donde dicho contaminante al menos uno es seleccionado del grupo consistente de lentivirus competente para la replicación (RCL), p24, ácido nucleico del glicoproteína G del virus de la estomatitis vesicular (VSV-G) y gag del virus de inmunodeficiencia humana (VIH); dicho método comprende a) centrifugar un cultivo de dicha célula T modificad, realizar un ensayo PCR evaluando por ELISA para p24 en el sobrenadante centrifugado para detectar la replicación del lentivirus competente (RCL); b) realizar un ELISA para detectar p24; o c) realizar un ensayo PCR cuantitativo para detectar el ácido nucleico VSV-G; en donde la célula T genéticamente modificada comprende un ácido nucleico que codifica un receptor de antígeno quimérico (CAR), en donde el CAR comprende un dominio de enlace de antígeno, un dominio de transmembrana, una región de señalización c