本发明公开了一种复合诱变的酸性蛋白酶高产菌株选育方法，包括以下步骤：a）孢子悬浮液制备：取恒温培养箱内的平板孢子，震荡后用无菌蒸馏水稀释，即得孢子悬浮液并备用；b）复合60Co‑γ与等离子体诱变：制取该菌株的孢子悬浮液，进行等离子体离子束注入，置于剂量0.5～2.0 KGy的辐照台面上，吸取60Co‑γ射线照射后的样品稀释、涂布于0.4%的干酪素培养基上；c）菌株筛选：c1)将干酪素培养基在35℃避光恒温培养2～4 d，挑选其中HC值大于平均值的变异菌株，接入分离培养基斜面保存备用；c2)取步骤c1）得到的菌株，加入1 mL 2%的硫代硫酸钠作为解毒剂，培养基中30℃培养2d，选育出酸性蛋白酶酶活力提高值最大的为高产菌株。
