本发明公开了一种水稻蔗糖转运载体类似蛋白基因及其编码蛋白与应用,本发明所提供的水稻蔗糖转运载体类似蛋白基因,是下列核苷酸序列之一:1)序列表中SEQID№:1的DNA序列;2)编码序列表中SEQ ID №:2蛋白质序列的多核苷酸;3)与序列表中SEQ ID №:1限定的DNA序列具有90%以上同源性,且编码相同功能蛋白质的DNA序列。水稻蔗糖转运载体类似蛋白基因编码蛋白,是具有序列表中SEQ ID№:2氨基酸残基序列的蛋白质,或者是将SEQ ID №:2的氨基酸残基序列经过一个或几个氨基酸残基的取代、缺失或添加且具有与SEQ ID №:2的氨基酸残基序列相同活性的由SEQ ID №:2衍生的蛋白质。本发明的水稻蔗糖转运载体类似蛋白基因将在水稻育种中发挥重要作用。