An endoscope system is provided which can accurately calculate biological feature values such as oxygen saturation even in situations in which a variety of variable factors occur, such as misalignment between frames; an operation method of the endoscope system is also provided. Image variation for correction, obtained during a calibration mode, and image variation for measurement, obtained during a measurement mode, are compared. On the basis of the result of this comparison, a provisional correction value satisfying a specific condition is determined, from provisional correction values stored in a correction value storage unit, as the measurement correction value to be used for correction in the correction unit.La présente invention concerne un système d'endoscope qui peut calculer avec exactitude des valeurs de paramètres biologiques tels que la saturation en oxygène, même dans des situations impliquant un éventail de facteurs variables, comme le mésalignement des cadres ; la présente invention concerne également un procédé d'utilisation du système d'endoscope. Une variation d'image pour une correction, obtenue pendant un mode d'étalonnage, et une variation d'image pour une mesure, obtenue pendant un mode de mesure, sont comparées. Sur la base du résultat de cette comparaison, une valeur de correction provisoire satisfaisant à une condition spécifique est déterminée, à partir de valeurs de correction provisoires stockées dans une unité de stockage de valeurs de correction, en tant que valeur de correction de mesure devant être utilisée pour une correction dans l'unité de correction.フレーム間の位置ズレなど様々な変動要因が生ずる状況下においても、酸素飽和度などの生体特徴量を正確に算出できる内視鏡システム及びその作動方法を提供する。キャリブレーションモード時に得た補正用画像変動量と、計測モード時に得た計測用画像変動量とを比較する。比較した結果に基づいて、補正値用記憶部に記憶した仮補正値の中から、特定の条件を満たす仮補正値を、補正部での補正に用いる計測用補正値として決定する。