PURPOSE: An information processing apparatus for FD-OCT(Frequency Domain Optical Coherence Tomography) and a method thereof is provided to eliminate noise by performing a simple operation such as matrix subtraction.CONSTITUTION: An image scanning unit(100) produces depth information from the measured data and outputs an original tomographic image. A noise eliminating unit(200) eliminates noises from the original tomographic image and outputs a result tomographic image. The image output unit(300) outputs the result tomographic image from which noise is eliminated.COPYRIGHT KIPO 2013[Reference numerals] (10) Information processing apparatus for optical coherence tomography (100) Image scanning unit (20) Optical coherence tomography equipment (200) Noise eliminating unit (300) Image output unit본 발명은 광간섭 단층촬영 장비를 제어하여 측정 시점별로 측정 지점을 인접 위치로 이동하면서 상기 광간섭 단층촬영 장비로부터 측정 데이터를 수신하고, 상기 측정 데이터에 기초하여 깊이 정보를 산출하여, 원본 단층촬영 영상을 산출하는 영상 스캔부 및 상기 원본 단층촬영 영상에서 노이즈를 제거하여 결과 단층촬영 영상을 산출하는 노이즈 제거부를 포함하되, 상기 노이즈 제거부는 상기 원본 단층촬영 영상에 포함된 깊이 정보들간의 감산을 통해 상기 원본 단층촬영 영상에서 노이즈를 제거하는 주파수 영역 광간섭 단층촬영 정보처리 장치를 제공한다.