本发明涉及水稻品种资源特性的检测技术,尤其涉及一种检测水稻早衰基因的分子标记方法。检测水稻植株早衰的分子标记方法,该方法包括水稻植株DNA提取,将提取的DNA模板和特异性分子标记PCR扩增,对PCR反应产物检测判断水稻植株早衰性状的基因型;所述的特异性分子标记选自以下一条或两条结合使用:I、sg1,上游端如SEQ ID NO:1所示,下游端如SEQ ID NO:2所示;II、sg2,上游端如SEQ ID NO:3所示,下游端如SEQ ID NO:4所示;两者结合使用可检测AA、Aa和aa三种不同的基因型。本发明设计特异性分子标记sg1和sg2,对水稻苗期提取的DNA进行PCR扩增后,根据其PCR产物,检测水稻植株早衰性状的基因型,该方法具有检测准确性高,操作简单,成本低廉的特点。