本发明公开了一种黄颡鱼微卫星家系鉴定方法，它包括黄颡鱼亲本和子代基因组DNA提取、多态性微卫星标记筛选和引物合成、微卫星位点基因分型及家系鉴定等步骤，本发明采用了6对微卫星引物，其核苷酸序列分别如SEQ ID NO.1－12所示。本发明首次在黄颡鱼上利用荧光标记的多态微卫星标记建立了亲子鉴定平台，其鉴定准确率达到了98.9％，能快速、高效地鉴别黄颡鱼不同家系，为黄颡鱼的选育和繁殖配组提供了依据。本发明选择的微卫星位点等位基因数目较多，多态性高，可以用于黄颡鱼的群体遗传学评价、系谱认证、亲子鉴定，也能够用于分子标记辅助家系管理和分子标记辅助亲本选择。
