The present invention relates to Lactobacillus luteri used for the prevention of the total microbial imbalance in young mammals, in particular the prevention or treatment of reduced levels of actinobacteria and increased levels of proteobacteria and disorders associated therewith. Total microbial imbalance may have been caused by a number of factors including births due to cesarean section, intrauterine or postnatal antibiotic exposure, or by parenteral nutrition, hospitalization, psychological stress or gastrointestinal dysfunction. Disorders that can be treated or prevented by preventing or treating microbial total imbalance include but are not limited to infections, allergies, type I diabetes mellitus, insulin resistance, type 2 diabetes, celiac disease, peripheral and central hyperplasia, obesity, necrotizing enterocolitis, Diarrheal diseases, such as Crohn's disease and ulcerative colitis, and functional gastrointestinal disorders such as IBS, functional diarrhea, functional constipation, recurrent abdominal pain and indigestion.본 발명은 어린 포유동물에서 미생물총 불균형, 특히 감소된 수준의 악티노박테리아 및 증가된 수준의 프로테오박테리아의 예방 또는 치료 및 이와 관련된 장애의 예방 또는 치료에 사용되는 락토바실러스 루테리에 관한 것이다. 미생물총 불균형은 제왕절개에 의한 출생, 자궁 내 또는 출생 후 항생제 노출, 또는 비경구적 영양공급, 입원, 심리적 스트레스 또는 위장 기능장애에 의한 것을 포함하는 다수의 인자에 의해 초래되었을 수 있다. 미생물총 불균형을 예방 또는 치료함으로써 치료 또는 예방될 수 있는 장애는, 감염, 알레르기, I형 진성당뇨병, 인슐린 저항성, 2형 당뇨병, 셀리악병, 말초 및 중심 지방과다증, 비만, 괴사성 소장대장염, 염증성 장 질병, 예를 들어 크론병 및 궤양성 대장염, 및 기능성 위장 장애, 예를 들어 IBS, 기능성 설사, 기능성 변비, 재발성 복통 및 소화불량에 대한 경향을 포함한다.