本发明涉及一种生物技术领域的茄子花青素合成相关基因及其编码蛋白,所述基因为SmTTG1基因、或SmGL3基因、或SmTT8基因;所述SmTTG1基因编码的氨基酸序列如SEQ ID NO.2所示;所述SmGL3基因编码的氨基酸序列如SEQ ID NO.4所示;所述SmTT8基因编码的氨基酸序列如SEQ ID NO.6所示。利用本发明的茄子SmTTG1,SmGL3,SmTT8基因,可筛选出受其调控的与花青素合成密切相关的下游基因,以及与其相互作用的其他转录因子基因,从而探究茄子花青素合成路径调控机制。利用茄子SmTTG1,SmGL3,SmTT8基因也可以通过对基因进行位点突变,改变茄子中的基因序列,从而对茄子果实性状进行改变,达到提高其观赏价值和产量,实现更高的经济价值。