本发明利用由通用引物扩增得到的64条紫云蛤科序列,利用CLUSTALW软件比对分析,在确定的保守区域用引物设计软件Primer Premier 5设计多对引物,用200个紫云蛤科个体在10μl体系下反复进行PCR反应试验,最后经琼脂糖凝胶电泳检测,筛选出一种紫云蛤科贝类线粒体COI基因序列高效扩增引物,其特征是:COIZGF:5’-ACAAATCATTAAGGATATTGG-3’COIZGR:5’-GTCCGAAGAATCAAAACAAATG-3’采用本发明的紫云蛤科贝类线粒体COI引物,可以有效地扩增出紫云蛤科贝类不同物种的目的片段,扩增效率大于90%,能够满足紫云蛤科遗传多样性研究的需要,对紫云蛤科的资源保护和利用、多样性评估、遗传育种等方面将起到重要作用。