Clarification of a polynucleotide that is a new causative gene of cancer, and based on this finding, a method for detecting the polynucleotide or a polypeptide encoded by the polynucleotide, a kit and primer set for the detection, and an inhibitor of the polypeptide Screening methods, and a pharmaceutical composition for cancer treatment containing the inhibitor. In the detection method of the present invention, a FGFR3 fusion protein or a fusion gene encoding the fusion protein, or a TACC3 fusion protein or a fusion gene encoding the fusion protein is detected in a female genital organ-derived sample obtained from a subject.がんの新たな原因遺伝子であるポリヌクレオチドを解明し、この知見に基づき、当該ポリヌクレオチド又はそれがコードするポリペプチドの検出方法、前記検出のためのキット及びプライマーセット、前記ポリペプチドの阻害物質のスクリーニング方法、並びに前記阻害物質を含有するがん治療用医薬組成物を提供する。 本発明の検出方法では、被験者から得た女性生殖器由来試料中の、ＦＧＦＲ３融合タンパク質又は該融合タンパク質をコードする融合遺伝子、あるいは、ＴＡＣＣ３融合タンパク質又は該融合タンパク質をコードする融合遺伝子を検出する。
