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利用mRNA表达谱与竞争性内源RNA表达谱联合筛选蒽环类药物心脏毒性基因的方法
- 专利权人:
- 王亚帝
- 发明人:
- 王亚帝,任立群,李敏,陈素贤,何东宁
- 申请号：
- CN201610546197.8
- 公开号：
- CN106202993A
- 申请日:
- 2016.07.12
- 申请国别(地区):
- 中国
- 年份:
- 2016
- 代理人:
- 张伟
- 摘要：
- 本发明涉及一种利用mRNA表达谱与竞争性内源RNA表达谱联合筛选蒽环类药物心脏毒性基因的方法，包括步骤：通过mRNA和竞争性内源RNA表达谱芯片检测到大量基因的表达值，对所有基因的相关性进行排序；将获取的mRNA和竞争性内源RNA特征基因进行合并；通过遗传算法，对基因池进一步选择基因；通过比较乳腺癌患者、乳腺癌AIC患者及正常人mRNA与竞争性内源RNA联合表达谱不同，样本间的数据从而选出差异表达的基因；对差异表达基因预测，挑选score大于140，自由能小于‑20的作为可靠的靶基因；再从靶基因中挑选有显著差异的，用剩余部分RNA对构建的乳腺癌蒽环类药物心脏毒性发病目的靶基因进行验证。本发明可以候选出更为可靠的与蒽环类药物心脏毒性相关的潜在基因标志物。
- 来源网站：
- 中国工程科技知识中心
- 来源网址：
- http://www.ckcest.cn/home/
