Even organs that can not keep the fluorescence at all times to generate, its shape me to identify easily. Fluorescence-image generating unit that generates a plurality of fluorescent images (G2) by fluorescence picture is taken after a time interval from the observation target (F) and (21), each of which is generated by the fluorescent light image generation unit (21) In the fluorescence image (G2), the position extracting unit for extracting a high-intensity positions having a gray value greater than a predetermined threshold (22, a storage unit for storing a high-intensity position extracted by the position extracting unit (22) and (23), the route image generation section for generating a path image (G3) having a gradation value into a plurality of high intensity position stored in the storage unit (23) and (24), the pathway image generating unit (24 ) by providing a route image generated (display unit for displaying G3) (7) and a fluorescence observation apparatus comprising a (1).蛍光を常時発生させておくことができない臓器であっても、その形状を簡易に特定する。観察対象(F)からの蛍光を時間間隔をあけて撮影することにより複数の蛍光画像(G2)を生成する蛍光画像生成部(21)と、該蛍光画像生成部(21)により生成された各蛍光画像(G2)内において、所定の閾値以上の階調値を有する高輝度位置を抽出する位置抽出部(22と、該位置抽出部(22)により抽出された高輝度位置を記憶する記憶部(23)と、該記憶部(23)に記憶された複数の高輝度位置に階調値を有する経路画像(G3)を生成する経路画像生成部(24)と、該経路画像生成部(24)により生成された経路画像(G3)を表示する表示部(7)とを備える蛍光観察装置(1)を提供する。