본 발명은 음이온성 실리카 전구체와, 방충성 에센셜 오일을 혼합하여 유기상을 제조하는 제1단계; 물, 알코올 및 양이온 계면활성제를 혼합하여 수상을 제조하는 제2단계; 및 상기 수상에 유기상을 첨가하여 음이온성 실리카 전구체의 가수분해에 의해 에센셜 오일을 포함하는 코어에 실리카 쉘을 형성하는 제3단계;를 포함하는, 코어-쉘 형태의 방충 나노 분말의 제조방법을 제공한다. 본 발명에 따르면 방출속도 컨트롤이 가능한 코어-쉘 형태의 방충 나노 분말을 제조할 수 있어, 화랑곡나방 유충을 방충하기 위한 용도로 PC(personal computer) 기판제조용, 포장 재질에 효과적으로 적용할 수 있다.