PURPOSE: A rooftop greening system to ensure good vegetation of tall tree or shrub without separate administration and a construction method thereof are provided to prevent the deformation of the waterproof layer of the concrete structure and the deterioration of the waterproof layer. CONSTITUTION: An asphalt primer layer(32) is coated on a frame bottom surface(30) of the building roof layer. A waterproof layer is laminated on the top of the asphalt primer layer. A root-proof sheet layer is laminated on the top of the waterproof layer. A drain board(38) is installed at the upper part of the proof sheet layer and a draining board combines with the water storage function. A nonwoven fabric mat is installed on the top of the draining board. A planting soil layer is laminated on the top of the nonwoven mat.본 발명은 건축물의 지붕층 녹화시에 골조 바닥면의 방수공정에서부터 배수공정 전반에 걸쳐 소요되는 각 공종들을 유기적으로 연결함으로써 안전한 기반을 구축하여 콘크리트 구조체의 균열 발생이나 거동에 신뢰적으로 대응하고, 화단조성에 따른 토양층의 상시 습윤 조건으로 인한 방수층의 열화를 방지하며, 별도의 관리 없이도 교목 또는 관목의 원활한 식생이 이루어질 수 있도록 한 건물지붕층 녹화시스템 및 그의 시공방법에 관한 것이다.본 발명은, 건물 지붕층의 골조 바닥면 및 벽부에 드레인 위치를 정하고, 상기 드레인 위치에 코어홀을 형성하여 드레인을 설치하는 제1 단계; 물이 원활하게 배수될 수 있도록 상기 골조 바닥면으로부터 드레인을 향하여 구배를 부여하고 제물미장을 실시하는 제2 단계; 상기 지붕층의 골조에 화단벽체를 구축하는 제3 단계; 상기 골조 바닥면에 방수층을 시공하는 제4 단계; 상기 방수층의 상부에 방근시트층을 적층하는 제5 단계; 상기 방근시트층 상부에 저수 및 배수기능을 겸비하는 배수판을 설치하는 제6 단계; 식생재 뿌리의 활착 방지와 식생토양의 유실방지 및 토양여과층으로서 기능을 하는 부직포 매트를 상기 배수판위에 설치하는 제7 단계; 및 상기 부직포 매트위에 식생토 메우기를 실시하는 제8 단계를 포함하는 건물지붕층 녹화시스템의 시공방법을 제공한다.