Introduced in the present invention is a pill packaging apparatus with a cleaning function. The pill packaging apparatus with a cleaning function comprises: a supply unit which supplies multiple pills at the same time; a transfer unit composed of an upper transfer unit which includes multiple main tracks, aligned in parallel in the horizontal direction in order to transfer multiple pills supplied from the supply unit through different paths by being connected to the supply unit, a first lower transfer unit which includes multiple first sub-tracks, whose top unit is connected to the bottom unit of the main track and where multiple first guide rails are aligned in parallel in the horizontal direction so that the pills supplied from the main track can be separated and transferred into different paths, and a second lower transfer unit which includes multiple second sub-tracks whose top unit is connected to the bottom unit of the first sub-track and where a second guide rail is formed to correspond to the first guide rail; a discharge unit which discharges the pills, supplied from the transfer unit along different paths, to different paths; and a suction unit which sucks dusts generated from the pill transfer process on the bottom of the transfer unit.본 발명의 클리닝 기능을 갖는 알약 포장장치가 소개된다.본 발명의 클리닝 기능을 갖는 알약 포장장치는, 복수개의 알약을 동시에 공급하는 공급부; 상기 공급부와 연결되어 상기 공급부로부터 공급받은 복수 개의 알약을 서로 다른 경로를 통해 이송할 수 있도록 횡 방향으로 나란히 배열된 복수 개의 메인트랙을 포함하는 상부 이송부와, 그 상단부가 상기 메인트랙의 하단부와 연결되고 상기 메인트랙으로부터 공급되는 알약이 서로 다른 경로로 나뉘어져 이송될 수 있도록 각각 복수 개의 제1가이드레일이 횡 방향으로 나란히 배열된 복수 개의 제1서브트랙을 포함하는 제1하부 이송부와, 그 상단부가 상기 제1서브트랙의 하단부와 연결되고 상기 제1가이드레일과 대응되는 제2가이드레일이 형성된 복수 개의 제2서브트랙을 포함하는 제2하부 이송부를 포함하는 이송부; 상기 이송부로부터 서로 다른 경로를 따라 공급되는 알약을 각각 서로 다른 경로를 통해 배출하는 배출부; 및 알약 이송 과정에서 발생되는 분진을 상기 이송부의 저면에서 흡입하는 흡입부를 포함한다.