Disclosed herein are methods, compositions, and kits for highly efficient site-specific genome editing of cells. A method for altering a target polynucleotide sequence in a cell comprising the regularly spaced short palindromic repeat-associated (Cas) protein clustered with the polynucleotide sequence and one to two ribonucleic acids A cell in which the ribonucleic acid directs the Cas protein to the target motif of the target polynucleotide sequence and hybridizes with the target motif, wherein the target polynucleotide sequence is cleaved and expresses the Cas protein Wherein the efficiency of change is from about 50% to about 80%.本明細書において、細胞の高効率な部位特異的ゲノム編集のための方法、組成物、およびキットが開示される。細胞における標的ポリヌクレオチド配列を変更するための方法であって、前記方法が、前記ポリヌクレオチド配列をクラスター化した規則的な間隔の短いパリンドローム様リピート関連(Cas)タンパク質および1~2つのリボ核酸と接触させることを含み、前記リボ核酸が、Casタンパク質を前記標的ポリヌクレオチド配列の標的モチーフに方向づけ、かつ前記標的モチーフとハイブリダイズし、前記標的ポリヌクレオチド配列が切断され、Casタンパク質を発現する細胞の変更効率が約50%~約80%である、方法。