本发明公开了一种玉米Ⅱ型H+-焦磷酸酶基因启动子的缺失突变体及其应用,其中所述缺失突变体是位于玉米II型H+-焦磷酸酶基因(ZmVP2)起始密码子ATG上游的219bp的连续碱基序列,该缺失突变体命名为玉米Ⅱ型H+-焦磷酸酶基因(ZmVP2)启动子的缺失突变体D8;所述玉米Ⅱ型H+-焦磷酸酶基因启动子的核苷酸序列如SEQ ID No.1所示,所述缺失突变体D8的核苷酸序列如SEQ ID No.2所示。实验证实,本发明的D8启动子能够启动下游基因在转基因植物受体中较高水平表达,且具有明显的盐和干旱胁迫诱导特性,在植物耐盐、抗旱基因工程育种中具有很好的应用价值。