本发明为“菲利普孢囊线虫特异性SCAR标记及其快速PCR检测方法”,属生物技术领域。菲利普孢囊线虫特异性SCAR标记的DNA片段,其特征在于该DNA片段具有如SEQ ID NO1所示的核苷酸序列。根据菲利普孢囊线虫特异性SCAR标记的DNA片段设计的引物HfF1和HfR1,在PCR快速检测菲利普孢囊线虫的方法中,可扩增出313bp的片段,同时还可以在PCR反应体系中加入通用引物TW81和AB28作为内标,能同时扩增出1000bp的片段。本发明提高了分子检测灵敏度并且快速准确,在菲利普孢囊线虫检测和菲利普孢囊线虫病的早期诊断方面,具有很高的应用价值。