The present invention provides a growth box system for planting hydrophytes for removing non-point pollution, which comprises multiple growth boxes having the lower part having a reservoir capable of storing or detaining and purifying water, and the upper part filled with filter media and covered with porous holes or a screen for facilitating inlet or exhaust of water； and inlet and outlet pipes connecting the multiple growth boxes and formed to conduct inlet and exhaust of source water, wherein the upper parts of the multiple growth boxes are connected to the inlet and outlet pipes, and are formed with inlet and outlet parts so that fluid is able to flow therein.본 발명은 하부는 물을 저장 또는 체류 및 정화하도록 하는 저장조로 형성되고, 상부는 여과재가 충진되며, 물의 유입 또는 유출이 용이하도록 유공홀 또는 스크린으로 덮여지는 복수의 성장박스； 상기 복수의 성장박스 사이를 연결하도록 하며, 원수의 유입 및 배출을 행하도록 형성되는 유입유출관；을 포함하여 형성되되, 상기 복수의 성장박스 상부는 상기 유입유출관과 연결되며, 그 내부에 유체가 흐를 수 있도록 하는 유입유출부가 형성되는 비점오염제거를 위한 수생식물식재용 성장박스 시스템이 제공된다.
