The present invention relates to use of a CnKTR3 gene encoding glycosyltransferase to be applied for treating fungal infection by Cryptococcus neoformans. The present invention provides a method for screening an antifungal agent including the steps of: making a cell including CnKTR3 protein contact a test substance; measuring a degree of expression or activity of the CnKTR3 protein in the cell contacting the test substance; and selecting the test substance of which expression or activity of the CnKTR3 protein is reduced by comparing the test substance with a sample of a control group. Moreover, the present invention provides an antifungal and pharmaceutical composition including an inhibitor against expression or activity of the CnKTR3 protein. A homologue to the CnKTR protein does not exist in a human body. Therefore, fungus-specific α1,2-mannosyltransferase is considered to be used as a target, which is very useful for developing an antifungal agent.본 발명은 크립토코쿠시스 네오포만스(Cryptococcus neoformans)에 의한 진균 감염 치료에 활용하기 위한 당전이효소 유전자 CnKTR3의 용도에 관한 것이다. 본 발명은 CnKTR3 단백질을 포함하는 세포에 시험물질을 접촉시키는 단계; 상기 시험물질을 접촉한 세포에서 CnKTR3 단백질의 발현 또는 활성 정도를 측정하는 단계; 및 대조구 시료와 비교하여 상기 CnKTR3 단백질의 발현 또는 활성 정도가 감소한 시험물질을 선별하는 단계를 포함하는 항진균제 스크리닝 방법을 제공한다. 또한, 본 발명은 CnKTR3 단백질 발현 또는 활성 억제제를 유효성분으로 포함하는 항진균용 약학 조성물을 제공한다. 본 발명의 CnKTR3 단백질에 대한 상동체가 인체에는 존재하지 않으므로 진균 특이적 α1,2-만노실 전이효소는 항진균제 개발에 매우 유용한 타겟으로 활용될 것으로 사료된다.