The present invention provides compounds for the treatment of autoimmune related diseases, in particular Antrodia camphorata camphorata ) Extract, 4-hydroxy-2,3-dimethoxy-6-methyl-5, isolated and purified from extract, which can be applied to treat autoimmune diseases such as systemic lupus erythematosus (SLE) And (3,7,11-trimethyl-dodeca-2,6,10-trienyl) -cyclohex-2-enone compound. The cyclohexenone compounds according to the present invention reduce proteinuria and antinuclear antibody titers in SLE mammals, as well as renal inflammation and disease, as well as alleviating autoimmune damage caused by antinuclear antibodies. The purpose of prevention and treatment of autoimmune diseases by substances having no natural side effects can be achieved.Antrodia camphorata, systemic lupus erythematosus, cyclohexenone compound, antinuclear antibody본 발명은 자가면역 관련 질병을 치료하기 위한 화합물, 특히 안트로디아 캄포라타 (Antrodiacamphorata) 추출물로부터 단리되고 정제되며 전신 홍반 루푸스 (systemic lupus erythematosus) (SLE)와 같은 자가면역질환을 치료하기 위해 적용될 수 있는 추출물, 4-히드록시-2,3-디메톡시-6-메틸-5(3,7,11-트리메틸-도데카-2,6,10-트리에닐)-시클로헥스-2-에논 화합물에 관한 것이다. 본 발명에 따른 시클로헥세논 화합물은 SLE 포유동물에서 단백뇨 양과 항핵 항체 역가를 감소시켜서 신장 염증과 질병을 경감시킬 뿐만 아니라 항핵 항체에 의해 유발된 자가 손상을 경감시킨다. 천연의 부작용을 갖지 않는 물질에 의한 자가면역 질병의 예방 및 치료 목적이 달성될 수 있다.