The present invention relates to a method for preparing a natural neutral flavor, and more particularly to a method of preparing a natural neutral flavor using an inosine-5&prime-monophosphate (IMP) fermented broth or a glutamic acid fermented broth prepared by a two-step fermentation process comprising a first fermentation step for fungal fermentation and a second fermentation step for bacterial fermentation, a natural neutral flavor prepared by the method, and a food composition comprising the natural neutral flavor. The natural neutral flavors prepared according to the method of the invention are prepared using natural raw materials, and thus are harmless and safe for use in the human body, and may be added to food to produce clean and mild tastes, and improve the flavor of the food.본 발명은 천연 뉴트럴 조미소재의 제조 방법에 관한 것으로서, 보다 상세하게는 1단계 곰팡이 발효 및 2단계 세균 발효인 2단계 발효 과정을 거쳐 제조된 이노신산(IMP) 발효액 및 글루탐산(glutamic acid) 발효액을 이용하여 천연 뉴트럴 조미소재를 제조하는 방법, 상기 방법에 의해 제조된 천연 뉴트럴 조미소재 및 상기 조미소재를 포함하는 식품 조성물에 관한 것이다. 본 발명의 방법으로 제조한 천연 뉴트럴 조미소재는 천연원료를 이용하여 제조함으로써 인체에 무해하고 안전함과 동시에, 식품 내에 첨가하여 깔끔하고 순한 맛을 냄으로써 풍미를 증진시킬 수 있다.