The present invention relates to a medical image processing apparatus and a medical image processing method for a surgical navigator, and more particularly, to an apparatus and method for processing an image provided in the use of the surgical navigator. To this end, the present invention provides a medical image processing apparatus for a medical navigation apparatus, comprising: a position tracking unit for obtaining location information of a medical navigation apparatus in an object; A memory configured to store medical image data generated based on the medical image of the object; And a processor configured to set a region of interest based on location information of the medical navigation apparatus based on the medical image data, and generate partial medical image data corresponding to the region of interest. It provides a medical image processing apparatus comprising a and a medical image processing method using the same.본 발명은 수술용 네비게이터를 위한 의료 영상 처리 장치 및 의료 영상 처리 방법에 관한 것으로서, 더욱 상세하게는 수술용 네비게이터의 사용시 제공되는 영상을 처리하기 위한 장치 및 방법에 관한 것이다.이를 위해 본 발명은, 의료용 항법 장치를 위한 의료 영상 처리 장치로서, 대상체 내에서의 의료용 항법 장치의 위치 정보를 획득하는 위치 추적부; 상기 대상체에 대한 의료 영상에 기초하여 생성된 의료 영상 데이터를 저장하는 메모리; 및 상기 의료 영상 데이터를 기준으로 한 상기 의료용 항법 장치의 위치 정보에 기초하여 관심 영역을 설정하고, 상기 관심 영역에 대응하는 부분 의료 영상 데이터를 생성하는 프로세서; 를 포함하는 의료 영상 처리 장치 및 이를 이용한 의료 영상 처리 방법을 제공한다.