The present application provides methods for diagnosing and treating a subject with IBS. In certain embodiments, the method also includes diagnosing a subject responsive to IBS treatment with rifaximin. The method includes determining the identity and prosperity of the bacterial group in the gastrointestinal (GI) tract. In certain embodiments, the microbiome comprises a GI tract microbiome. In certain embodiments, the microbiome comprises a GI tract microbial population. In certain embodiments, the microbiome comprises stool bacteria. The method includes an attribution analysis for the bacteria group in the gastrointestinal (GI) microbiome to generate a diversity profile of the bacteria group. [Selection] Figure 1本出願は、IBSを有する対象を診断及び治療する方法を提供する。特定の実施形態では、方法は、リファキシミンを用いたIBS治療に反応する対象を診断するステップも含む。方法は、胃腸(GI)管内のバクテリア群の帰属性及び繁栄性を判断するステップを含む。特定の実施形態では、ミクロビオームは、GI管ミクロビオームを含む。特定の実施形態では、ミクロビオームは、GI管微生物集団を含む。特定の実施形態では、ミクロビオームは、便細菌を含む。方法は、バクテリア群の多様性プロファイルを生成するための、胃腸(GI)ミクロビオーム内バクテリア群に関する帰属性分析を含む。【選択図】図１
