本发明公开了一种与猪免疫性状相关基因PSMB6克隆及其在猪遗传育种技术领域作为辅助选择的应用。克隆了猪免疫性状相关基因PSMB6的部分基因序列,它的DNA序列如序列表SEQ ID NO:1所示,该序列全长为587bp,其中包含如附图2所述的完整内含子1的序列,部分外显子1和部分的外显子2的序列。序列表SEQ ID NO:1的第72位碱基处有一个碱基突变(72A-72C),导致EcoO109I-RFLP多态性;序列表SEQ IDNO:1的第300位碱基处有一个碱基突变(300T-300G),导致EcoRI-RFLP多态性。应用本发明分别对原产于中国地方猪种和欧洲的血统的猪种进行了相关检测,肯定了本发明用于猪遗传辅助选择的效果。本发明还提出了制备上述基因和用于检测应用的方法。