Problem to be solved: to provide a medical image processing apparatus and a medical image diagnostic system capable of displaying a running direction or shape of a blood vessel in which a blood flow is stagnant and capable of displaying on a medical image.A medical image processing apparatus according to one embodiment is based on an extraction part for extracting a lesion part included in volume data and an estimated part for estimating the occluded blood vessel on the volume data based on the distribution of the extracted lesion, and a proposition An image generating section for generating a superimposed image superimposed on an X-ray fluoroscopic image with an image representing the occluded blood vessel is provided.Diagram【課題】血液の流れが滞っている血管の走行方向又は形状を推定し、医用画像上に表示可能な医用画像処理装置及び医用画像診断システムを提供する。【解決手段】一実施形態に係る医用画像処理装置は、ボリュームデータに含まれる病変部を抽出する抽出部と、抽出された前記病変部の分布に基づいて、前記ボリュームデータ上における閉塞血管を推定する推定部と、推定された前記閉塞血管を示す画像をX線透視画像に重畳した重畳画像を生成する画像生成部と、を備える。【選択図】 図2