Provided is a method for preparing a sugar solution from which a thermotolerant acidophilic bacteria growth factor that can grow thermotolerant acidophilic bacteria, which are bacteria mainly responsible for the deterioration or rottenness of foods or beverages, is eliminated or reduced. A sugar solution is prepared through the following steps: (a) a step of adding an acid to a raw material sugar solution; (b) a step of filtering the sugar solution prepared in the step (a) through an electrically charged filtration membrane; and (c) a step of collecting a filtrate as the desired sugar solution.본 발명은 음식품의 변패의 주된 원인균인 내열성 호산성균을 증식시키는 내열성 호산성균 증식 팩터가 제거 또는 감소되어 이루어지는 당액의 제조 방법을 제공한다. 본 발명은 (a) 원료 당액에 산을 가하는 공정, (b) 상기 (a) 공정에서 제조한 당액을 하전 여과막으로 여과하는 공정, 및 (c) 여액을 상기 목적 당액으로서 회수하는 공정을 거쳐 당액을 제조한다.